A New Algorithm for Convex Biclustering and Its Extension to the Compositional Data

نویسندگان

چکیده

Biclustering is a powerful data mining technique that allows simultaneously clustering rows (observations) and columns (features) in matrix-format set, which can provide results checkerboard-like pattern for visualization exploratory analysis wide array of domains. Multiple biclustering algorithms have been developed the past two decades, among convex guarantee global optimum by formulating as optimization problem. On other hand, application has not progressed parallel with algorithm techniques. For example, increasingly popular microbiome research under-applied possibly due to its compositional constraints each sample. In this manuscript, we propose new algorithm, called bi-ADMM, under general setups based on ADMM free extra smoothing steps visualize informative biclusters required existing algorithms. Furthermore, tailor it named biC-ADMM specifically tackle confronted data. The key step our methods utilize Sylvester Equation derive research. effectiveness proposed examined through variety numerical experiments application.

برای دانلود رایگان متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

a new approach to credibility premium for zero-inflated poisson models for panel data

هدف اصلی از این تحقیق به دست آوردن و مقایسه حق بیمه باورمندی در مدل های شمارشی گزارش نشده برای داده های طولی می باشد. در این تحقیق حق بیمه های پبش گویی بر اساس توابع ضرر مربع خطا و نمایی محاسبه شده و با هم مقایسه می شود. تمایل به گرفتن پاداش و جایزه یکی از دلایل مهم برای گزارش ندادن تصادفات می باشد و افراد برای استفاده از تخفیف اغلب از گزارش تصادفات با هزینه پائین خودداری می کنند، در این تحقیق ...

15 صفحه اول

Convex biclustering.

In the biclustering problem, we seek to simultaneously group observations and features. While biclustering has applications in a wide array of domains, ranging from text mining to collaborative filtering, the problem of identifying structure in high-dimensional genomic data motivates this work. In this context, biclustering enables us to identify subsets of genes that are co-expressed only with...

متن کامل

A Fuzzy C-means Algorithm for Clustering Fuzzy Data and Its Application in Clustering Incomplete Data

The fuzzy c-means clustering algorithm is a useful tool for clustering; but it is convenient only for crisp complete data. In this article, an enhancement of the algorithm is proposed which is suitable for clustering trapezoidal fuzzy data. A linear ranking function is used to define a distance for trapezoidal fuzzy data. Then, as an application, a method based on the proposed algorithm is pres...

متن کامل

the algorithm for solving the inverse numerical range problem

برد عددی ماتریس مربعی a را با w(a) نشان داده و به این صورت تعریف می کنیم w(a)={x8ax:x ?s1} ، که در آن s1 گوی واحد است. در سال 2009، راسل کاردن مساله برد عددی معکوس را به این صورت مطرح کرده است : برای نقطه z?w(a)، بردار x?s1 را به گونه ای می یابیم که z=x*ax، در این پایان نامه ، الگوریتمی برای حل مساله برد عددی معکوس ارانه می دهیم.

15 صفحه اول

ذخیره در منابع من


  با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ژورنال

عنوان ژورنال: Statistics in Biosciences

سال: 2022

ISSN: ['1867-1772', '1867-1764']

DOI: https://doi.org/10.1007/s12561-022-09356-4